При установке phpmyadmin из портов, автоматически устанавливается php, однако (в данный момент) если это осуществить, то php не будет установлен как модуль apache. Поэтому предварительно устанавливаем php:

Появится окно настроек, в котором необходимо поставить галку напротив пункта "Build Apache module".

После установки, в конфиге апача (/usr/local/etc/apache22/httpd.conf) должна появится такая строка:

LoadModule php5_module libexec/apache22/libphp5.so

Отредактируем конфиг:

и в конце конфига добавляем строки:

Также находим строку, начинающуюся с DirectoryIndex. Изменяем ее на:

Теперь устанавливаем phpmyadmin:

В конце установки отобразится текст о том, что нужно добавить в конфиг апача, на данный момент следующее:

    Alias /phpmyadmin/ "/usr/local/www/phpMyAdmin/"

    
        Options none
        AllowOverride Limit

        Order Deny,Allow
        Deny from all
        Allow from 127.0.0.1 .example.com
    

Заменяем Allow from 127.0.0.1 .example.com на Allow from all

Теперь создаем конфиг для phpmyadmin:

В куче менюшек-кнопок выбираем: add

В появившейся страничке выбираем:

Authentication type: http

Сохраняем.

Выбираем кодировку: жмем кнопку charsets и в поле default charset выбираем windows-1251, жмем update

Жмем save - конфигурация сохраняется

Появляется окно авторизации, в которое вводим логин root и его пароль как учетной записи mysql (не системы).